O Departamento de Psicobiologia originou-se como Setor de Psicofarmacologia do Departamento de Farmacologia em 1971, tornando-se em pouco tempo um departamento independente. Os professores do Departamento estão distribuídos em quatro disciplinas: Psicofarmacologia, Psicobiologia, Medicina e Biologia do Sono e Medicina e Sociologia do Abuso de Drogas. O curso de Pós-graduação teve início ainda nesse ano, como área de concentração em Psicofarmacologia no programa de Pós-Graduação em Farmacologia da Escola Paulista de Medicina. Em 1987, a CAPES aprovou a independência do programa de Pós-graduação, que passou a ser denominado Programa de Pós-Graduação em Psicobiologia, na área de Ciências Biológicas. A partir de 1999, o Programa passou a fazer parte da área de Medicina devido à ampliação de sua área de atuação. As áreas de concentração do Programa de Pós-graduação foram recentemente renovadas e representam as principais linhas de pesquisa dos orientadores. São elas: Neurobiologia da Emoção, Motivação e Cognição, Medicina e Biologia do Sono, Medicina e Sociologia do Abuso de Drogas e Bases Celulares e Moleculares do Comportamento. Este Programa integra professores do Departamento e outros orientadores cadastrados.